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2009/02/02 16:45

(0) 면역반응에 관련한 NFkB 활성화의 일반적 기전

 

그람 음성 세균의 LPS TNF알파 같은 cytokine의 과량 분비로 인한 septic shock을 유발한다. 예를 들어 salmonella typhi의 감염자들은 TLR-4(toll like receptor-4) TLR-5를 활성화시켜 전신에서 TNF알파를 생성시킨다. (TLR은 세포막이나 endosome에 위치하며 macrophage CD14와 추가적 세포단백인 MD-2와 함께 작용하여 LPS를 인식하여 신호를 전달한다.) 그런데, TLR4혼자서는 LPS를 인식할 수 없다. CD14 MD-2의 두 세표 표면 단백이 필요하다. 이 기전은 macrophage CD14 LPS의 결합이 이뤄져 CD14:LPS의 복합체가 MD-2의 결합으로 인하여 세포 표면으로 이동한 TLR과 결합하여( CD14:LPS + TLR-4:MD-4의 결합) 핵에 NFkB를 활성화시키는 신호를 보낸다.(면역학 교과서 fig2.19 참조)

 

이후 Fyn, Lck, ZAP-70등이 관여하는(fig 6.18참조) 복잡한 신호 전달을 거쳐 cell 표면에서 PLC감마pathway가 활성화된다. PLC pathway NFkB NFAT, AP-1의 활성화를 유도하는데 특히 NFkB에서는 DAG가 관여하여 골격단백질 CARMA1을 인산화시키고 BCL 10, MALT1과 결합시켜 결국 IKK complex를 활성화시킨다. 그 중에서도 NEMO IkB를 인산화시키고 분해시킨다.(NEMO가 없으면 면역 결핍증이 유발.) (fig6-22참조)

 

이들 염증 pathway의 중요한 기능은 IL-2의 증식을 자극한다는 것이다. IL-2 promoter에는 여러 조절 요인이 있는데 이 pathway의 결과로써 AP-1 NFAT, NFkB가 모두 결합할 때 비로소 적절한 IL-2유전자의 expression이 일어나게 된다. (fig. 6-23 참조)

 

그런데, 장내 편리공생 세균의 경우는 염증반응을 일으키지 않는다. 이 경우의 세균들은 이 경로를 억제한다고 알려져 있는데 이것은 핵으로부터 NFkB를 방출하도록 하는 PPAR감마의 활성화에 의하거나 혹은 IkB가 분해되지 않도록 차단하여 NFkB nucleus로 이동하지 않고 cytoplasm에 머물도록 하는 것이다.

 

(1) NFkB and oncogenesis

 

-T-cell lymphoma, chronic lymphocyte leukemia, myeloma, B-cell lymphoma 등에서 p52/100encode하는 NFkB2 gene mutation이 발견되었다.

-B-cell lymphoma에서는 IkB family encode하는 Bcl-3dl translocate되거나 overexpression된 것이 발견되었다.

-gene 뿐만이 아니라 NFkB target들이 oncogenic phenotype promote하는 경향이 있음이 밝혀 졌다.(예를 들어 B-cell lymphoma growth survival을 위하여 NFkB의 활성화가 필수적이며 NFkB inhibit되면 lymphoma block되는 것이 동일 케이스에서 발견되었다.)

-cancer와 관련된 NFkB dependent gene에는 cytokine chemokine, cyclinD1, matrix metalloproteinase, antiapoptototic protin encoding하는 gene들이 포함된다.

 

(2)NFkB and cancer-associated mechanism

 

-hallmark of cancer라 알려진 특징들은 여러 경로를 통하여 모두 NFkB에 의하여 영향을 받는다.

 

a.growth and proliferation

 

-growth를 자극하는 common pathway는 두가지 정도가 있다.

-1.첫번째로 epithelial cancer에서의 EGF-R family(EGF receptor or HER-2/ErbB2 receptor)upregulation이다. 추가적으로 PDGF TGF알파가 주로 발현되고 proliferation autocrine한 방법으로 promote된다. 또한 paracrine한 방법으로 cancer associated stromal cell이나 recruited inflammatory cell에 의하여도 proliferation stimulate된다.

-2.두번째로 cell proliferationregulation하는 protein mutation 메커니즘이다. Cellular RAS allele mutation cell growth survival에 관련된 PI3K/Akt RalGDS 같은 signal transduction pathway를 자극한다. 추가적으로 cancer cell growth에 관여하는 베타 catenin같은 transcription factor activating mutation이다. 이 베타catenin cyclin D1이나 c-myc같은 proliferation을 자극하는 gene의 발현을 control한다.

- NFkBspecific target gene regulation을 통하여 cellular proliferation promote한다.

-예를 들어 NFkBcyclin D1 promoter와 결합하여 Rbhyperphosphorylation promote한다. 추가적으로 IkB homolog Bcl-3 p52 homodimer cyclin D1 gene transactivate시킨다는 것이 발견되었다. 더 나아가 IKK알파는 베타catenin 인산화를 통하여 promoter T-cell factor site 를 통하여 cyclin D1 transcription에 역할을 하는 것으로 알려졌다.

-이것을 뒷받침하는 사례로 karin mammary glanddevelopment 중에 RANK signaling cyclin D1 expression을 위해서는 IKK알파가 필요함을 밝혀내었다.

-이런 보고들과 관련하여 mouse xenograft model에서 NFkB inhibit되는 경우 tumor growth가 줄어드는 것이 관찰되었다.

 

b.apoptosis evasion

 

-NFkB에 의하여 regulate되는 Bcl-2 Bcl-xL같은 antiapoptotic factor들이 cancer에서 주로 발현된다.

-NFkB apoptosis의 강력한 연관을 참조하였을 때 NFkB oncogenesis에서 antiapoptotic mechanism control한다는 것은 자명하다.

-마우스의 immortalized fibroblast에서, H-RasV12의 발현이 IkB degradation resistance form을발현시켜서 cellular transformation NFkB inhibition을 유발하여 고level apoptosis를 가능하게 한다고 밝혀졌다.

-이 마우스 실험은 Ras induced oncogenesis에서 NFkB prosurvival function을 한다는 것을 의미한다.

-그런 맥락에서 NFkB inhibition -> apoptotic cell death 추론가능하다.

-예를 들어 이것은 Hodgkin/Reed-sternberg cell survival proliferation IkB알파의 발현을 통하여 NFkB inhibit한 경우 block되었다. cell에서 NFkB inhibition은 또한 antiapoptotic effectors(A1/Bfl-1, cellular-inhibitor of apoptosis2(c-IAP2), TNF associated factor1, Bcl-xL)를 억제했다.

-또다른 NFkB cell death block하는 메커니즘은 c-Jun NH2-terminal kinase(JNK) activation ROS의 생성이다.

 

   

 

c. angiogenesis, invasion and metastasis

 

-angiogenesisinvasion metastasis에 관련된 역할을 한다.

-또한 invasion metastasis 에는 adhesion molecules, integrin, MMP-2, MMP-9 같은 것들의 expression이 필요하다.

-cancer progression에 가장 중요한 메커니즘으로는 epithelial to mesenchymal transition이 있다. 이것은 분화된 epithelial phenotype apical에서 basolateral 영역까지 polarity를 띄는 반면 많은 cancer에서는 metastatic phenotype으로의 progression과 더불어 이 phenotype alteration이 일어난다.

-NFkB가 이 메커니즘에서 역할을 한다. NFkB VEGF MMPs regulation을 통하여 특정한 tumor model에서 angiogenesis metastasis promote하는 것으로 밝혀졌다. 관련해서 NFkB에 대한 IkB의알파의 super repressor form expression을 이용한 억제가 melanoma ovarian cancer cell에서 VEGF, IL-8의 발현 감소와 tumor xenograft에서의 growth, angiogenesis, metastasis block하는 것으로 밝혀졌다.

-게다가 폐에서 IkB베타의 과발현을 통한 NFkB inhibitionmetastasis를 억제하는 것으로 알려져있다.

-이런 연구들은 종종 NFkB의 억제가 tumor growth를 막는다고 밝히지만, NFkB가 직접적으로 angiogenesis metastasis control하는 것인지 증명하는 것은 사실 매우 어렵다.

-결과적으로 NFkB, 정확한 기전은 분명하지 않지만 epithelial-mesenchymal transition을 매개한다는 것은 밝혀졌다.

 

(3)NFkB in the tumor micro-enviorment

 

-NFkB tumor associated cell에서 oncogenic affect를 일으키는 기능을 일으킨다.

-colorectal cancer carcinogen/inflammation model myeloid cell에서 IKK베타 제거법을 활용하여 NFkB invading myeloid cell에서 cytokine을 분비시키고 tumor growth를 촉진시킨다는 것을 알아냈다.

-또다른 연구에서 NFkB stromal fibroblast pancreatic neoplastic cell에서 IL-1/NO paracrine growth loop를 매개한다고 밝혀졌다.

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유혜경 | 2009/05/18 22:46 | PERMALINK | EDIT/DEL | REPLY
다음주 논문 발표인데요 nfkb와 관련된 면역학 논문을 발표합니다
조사하던중 이 사이트를 찾았네요 ㅋ 많은 도움 되었습니다~ 감사합니다~
김민섭 | 2009/06/07 22:08 | PERMALINK | EDIT/DEL
댓글 이제 봤어요. 참고되었다니까 감사합니다. 그런데, 이걸 딴데다 올리거나 하지는 말아주세요. 교수님이 보실까봐 부끄러워서...
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2009/02/02 16:38

(1). ‘도입

 

NFkB 1986년 최초 발견 당시 kappa variety of the immunoglobin light chain regulate하는 factor로서 describe되었다. 그후 NFkBinflammatory responses, cellular growth, apoptosis, cancer, arthritis, asthma 또한 기타 등등에서도 active role을 하는 것으로 알려졌다.

 

(2). “NFkB family”의 구성

 

“NFkB family”는 두개의 subfamily로 나뉜다. - “NFkB” 단백질과 “Rel”단백질이다.

이 단백질들은 모두 Rel homology domain(RHD)을 공유한다.

 

a.Rel subfamily에 대하여

-“Rel” subfamily c-rel, RelB RelA(p65), dorsophilia dorsal, dif를 포함한다.

-Rel protein들은 C말단 부위에 transactivation domain을 포함하고 있는데 이것들은 주로 종간에서는 conseve하지 않은 것으로 알려져 있다. (여러 종들의 전사과정을 활성화시킬 수 있는 능력이 있다. yeast도 포함.)

 

b.NFkB subfamily에 대하여

-“NFkB” subfamily(p105, p100, dorsophilia relish)는 이들 단백질을 inhibit하는, ankyrin repeat multiple copy들을 포함하는 long C termibnal domail들에 의하여 구분된다.

-NFkB 프로테인은 DNA binding domain이 활성화 됨에 따라 짧아진다. 이것은 proteolysis나 때때로는 translation의 중단에 의한다.

 

(3) NFkB‘transcription activation’

 

-일반적으로 “NFkB” subfamily의 구성물들은 “Rel” subfamily들과 dimer를 형성해야지만 전사과정의 activator가 될 수 있다.

-NFkB transcription factor dimer는 보통 kB site라고 불리우는 9-10bp로 이뤄진, 매우 큰 다양성을 가진 DNA site에 붙는다.

-모든 척추동물의 NFkB family protien in vivio에서 homodimer heterodimer를 형성한다.(Rel B hetero만 형성가능) combination의 다양성은 regulation에 있어서 distinct하다.

그 이유는

1. dimer들은 관련된 kB site에 대한 명확한 DNA binding site specificity를 가지고 있다.

2. Target domain에서 각가 다른 protein-protein interaction을 일으킨다.

3.specific physiological 조건하에서 다른 dimer들의 gene activation profile 때문이다.

 

(4) regulation of NFkB

 

-NFkB activity inhibitory IkB protien들에 의하여 tight하게 regulate된다.

-IkB protien들은 NFkB에 따라 몇가지가 있는데 그것들은 각각의 NFkB dimer에 대하여 상이한 affinity를 가지고 있다.

-IkB는 또한 phosphorylation proteolysis에 의하여 약간씩 다르게 regulate되며 그것들의 tissue specific expression pattern에 따라 차이를 보인다.

-생화학적 연구와 structure determinations에 의하여 IkB NFkB multiple contact을 한다는 것이 명확해졌다.

-그리고 이런 contact를 통한 interaction들은 주어진 NFkB nuclear localization signal을 하며 DNA bindingsequence interfere하는 것으로 알려져 있다.

 

(5) activation pathway of NFkB

 

-일반적으로 대부분의 세포에서 NFkB latent(숨어있는)하거나 혹은 inactive한 상태로 IkB complex상태로 cytoplasm에 존재한다.

-NFkB activation에는 두 가지(혹은 세 가지일 가능성도 있다.) pathway들이 관여한다.

-두개의 가장 잘 알려진 pathwaycanonical(classic) non-canonical pathway(alternative). (canonical은 그리스어의 갈대나 rule에서 기원하는 단어인데 현재는 교회에서 정전이나 전례에 따르는, 이라는 뜻으로 사용된다.)

-canonical non-canonical pathway 모두에서 upstream regulation step IkB kinase(IKK) activation이다. 그리고 이 IKK들은 ‘catalytic kinase subunit’( IKK알파, IKK베타)‘NFkB Essential MOdulator(NEMO)’ 라는 scaffold, sensing protein으로 구성되어 있다.

-, NFkB dimer activation IKK mediated IkB inhibitor에 대한 phophorylation induced degradation에 의하여 유발되는 것이다. activation이후 NFkB dimer nucleus내로 들어가고 specific target gene expression시킨다.

-대부분의 경우 NFkBactivation은 지속적 inducer의 존재에도 일시적이거나 cyclical하다.  cycle IkB의 반복된 분해와 합성과 더불어 이 반복적 사이클이 유발하는 NFkB의 반복적인 activation inactivation에 기인한다.

-예를 들어 마우스의 TNF알파로 유지되는 fibroblast에서 NFkB DNA binding activity 30분에서 60분의 간격의 cycle을 가지는 것이 알려져 있다.

 

(6) anti NFkB therapy의 전망

 

-NFkB signaling modulator가 인간에게 사용될 것이라고 예상 가능하다

-지금까지는 NFkB에 대한 single step NFkB signaling inhibitor에 초점이 맞춰져 있었지만 앞으로는 NFkB의 저용량, multi-step inhibitor가 더 효과적일 수 있을 것입니다.

-아마도 우리는 앞으로 자연 유래의 NFkB inhibitor(녹차, curcumin(강황의 주요 물질), 항산화제)가 어떻게 인간의 건강에 도움을 주는지도 이해하게 될 것이다.

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병리학 프리젠테이션을 위해 NFkB의 내용을 정리한 초안이다. NFkB를 공부한 기념으로 보관해둔다.

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유혜경 | 2009/05/18 22:49 | PERMALINK | EDIT/DEL | REPLY
공부하는데 많은 도움되었습니다^^
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2009/01/15 23:03
한국을 포함한 어느 자유 민주 국가이든 그 체제의 사상적, 또한 물리적 근간을 구성하는 요소로서 사법부의 독립이 보장되어 있다. 사람들은 미네르바 구속 논란이 일어 사법부를 권력의 시녀라 의심한다. 그들은 의심을 '상당'한 수준으로 정당화시킬 수 있는 근거를 성립시키고 그런 차후에 정말로 사법부에 그런 문제가 있었다면 그것이 개인적 도덕의 부재탓인지 혹은 사법부와 입법부, 행정부 간의 한국 민주주의 체제에 잉태된 탓인지 가려야 할 것이다. 잘못된 점이 있었다면 이런 체제나 개인적 문책의 변화는 시민의 힘으로 대표되는 권력에 의하여 견제되고 달성되어야 한다. 우려스러운 것은 만약에 논의의 근본이 '체제'의 문제로 드러난다면 미네르바 논란의 이전에 자리 잡고 있는 끊이질 않는 '시녀'논란은 대한민국 건국과 동시에 시작되어 60년 이상 지속된 경향을 살폈을 때 한국인들의 의식 구조상 사실상 개선이 난망할 것이라는 사실이다. 시민의 대표자로 선출한 사람들이 시민을 적절하게 대표하고 있지 못한 탓인지 혹은 시민들이 '시녀'를 용인하는 도덕성을 가지고 민주주의를 진행시키지는 모르겠으나 어찌되었든 이 문제 역시 광우병 파동과 마찬가지로 사태가 귀속된 책임을 근본적 수준으로까지 환원시켜 그 책임주체의 질책과 그 스스로의 성찰이 이뤄져야 한다.

조선시대 임진왜란시 '위정자들은 도망갔지만 의병은 들고 일어났던 위대한 국민성'이 있었다고 생각하는 이들이 있다. 이 사람들은 의병들이 조선 북쪽 끝으로 도망가 월경을 고려하던 위정자의 지휘 계통에 직접적으로 속하여 자발적으로 지휘를 받았으며 전란 와중의 정치적 파벌 다툼탓에 내려지는 부대 해체 명령에도 순순히 응했다는 사실을 알아야 한다. 나는 이런 것이 조선인들의 거국적 애국심 덕택인지 혹은 지배층의 유교를 가장한 의식화 교육의 산물인지 아직도 의아하다. 그리고 이런 성향은 지금도 모습을 바꾼 채 지속되고 있다고 본다. 역사가 켜켜히 쌓여가도 사안의 말초적인 변화는 있겠지만 근본적인 변화는 없다. 이런 여러가지 측면에 기반하여 나는 한반도 상에 존재하거나, 존재했던 '시민'과 '신민'이 단지 단속적이라고도 생각하지 않는다.

종종 '상호주의'라는 말은 북한인들 보다는 한국인 상호간에 적용되어야 하는 말이 아닌가 싶다. 한국인들이 자주 터뜨리는 위정자들에 대한 불평은 사실 자신과 서로를 비난하는 것이다. 타임지는 "대부분의 아시아 국민들이 민주주의의 이상을 지지하고 있지만 통치자에 대한 의존도는 유럽은 물론이고 심지어 아프리카 국가들보다 훨씬 낮은 수준"이라면서 한국을 그 예로 들어 '한국민들의 후진적 민주의식을 비판'했다. 그것을 본 한국인들은 동 언론사 기사 말미의 의견란에 '국가 발전에 제일 걸림돌이 바로 국회의원'이나 '제2의 6.25전쟁'이 발발할 가능성 있을 것이라는 등의 반응을 보였다.
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파사현정권 | 2009/01/18 19:58 | PERMALINK | EDIT/DEL | REPLY
[가짜대통령 이명박 사형 결정 전문] 미ㄴㅔ르바? : 官error안봐??

[百姓有過 在여一人]<論ㅓ ㅛ曰>

대통령 스스로가 법을 존중하고 준수하지 않는다면,
다른 공직자는 물론,
국민 누구에게도 법의 준수를 요구할 수 없는 것이다.
<관습헌법? 대통령(노무현) 탄핵 결정 전문> / 가짜대통령 이명박 사형 결정 전문!
/ 관습헌법사항 한 줄조차 몰라서~? 미네르바에게 무슨 법의 준수를 요구하겠답시고??

의법, 무효대통령! 위헌대통령! 위법대통령! 불법대통령! 사기대통령! 대통령직장물대통령! 사이비대통령! 비합법대통령! 부적법대통령! 가짜대통령! 이명박을 사형으로 처단하라!~@!!
dead line(2009.02.09.)day
[명령章!] 이명박을 사형으로 처단하라!~!!.hwp / 이명박 운명 : 대한민국 대운
대역죄인대통령 치하의 국민들은 다 죄인~!!
김민섭 | 2009/01/19 22:27 | PERMALINK | EDIT/DEL
무슨 말씀을 하고 싶으신 건지 전혀 이해하질 못하겠습니다.
Hanjun | 2009/02/02 19:32 | PERMALINK | EDIT/DEL | REPLY
인터넷을 돌아 다니다 kms.linuxstudy.pe.kr/tc에서 마음에 드는 글을 보고 다음 블로그를 거쳐 여기까지 찾아왔습니다. 동갑 의대생이시군요. 자주 글써주세요.
김민섭 | 2009/02/02 19:44 | PERMALINK | EDIT/DEL
아 저기 옛날에 일기같이 비공개로 써놓았던 거 저장해두려고 만들었는데 까먹고 있었어요. 덕분에 잃어버릴 번 했던 글들 얻었네요 ㅎㅎ 어떻게 다음 블로그, 여기 링크를 찾아오셨는지 신기하네요 ㅎㅎ
Hanjun | 2009/02/02 23:05 | PERMALINK | EDIT/DEL
구체적으로 과정을 읊어보자면 linuxstudy.pe.kr 게시판에서 kms 검색후 이메일 주소 득템. 득템한 주소를 구글에 돌려서 다음블로그를 찾았고, 거기서 여기 주소를 찾았네요.
김민섭 | 2009/02/13 22:26 | PERMALINK | EDIT/DEL
ㅎㅎ집요하시네요. 그렇게 찾아올 정도로 제 블로그가 가치가 있을까 싶기도 하고;; 그런데 요새는 글을 잘 안쓰고 있어요. 예전에는 이 블로그 글이 대략 300개 정도 있었는데 얼마 전에 비공개로 다 돌려버렸기도 하고요.....
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